Celem wystawy Pojednanie dla Europy jest ukazanie znaczenia orędzia biskupów polskich do niemieckich jako części dziedzictwa zjednoczonej Europy. To przesłanie, oparte na wzajemnym przebaczeniu win, przełamywało trwający podział Europy „żelazną kurtyną” na dwa wrogie bloki – demokratyczny Zachód i komunistyczny Wschód, zdominowany przez Związek Sowiecki.
Wystawa pokazuje, że współczesna Europa zbudowana jest na pojednaniu, ponieważ wrogowie z okresu „europejskiej wojny domowej” wspólnie podjęli decyzję o budowaniu wspólnoty. Do 1989 r. projekt europejski obejmował jednak tylko zachodnią część kontynentu, ponieważ konsekwencją konfliktu były zmiany granic państwowych w Europie Środkowej, masowe przesiedlenia ludności i trwający prawie pół wieku podział Europy. Po zachodniej stronie „żelaznej kurtyny” pozostał wolny i demokratyczny świat, natomiast kraje po jej wschodniej stronie znalazły się pod dominacją Związku Sowieckiego, tracąc swoją niezależność i podmiotowość.
I właśnie od biskupów polskich zza „żelaznej kurtyny” wyszedł impuls do budowania od nowa stosunków polsko-niemieckich, opierając je na prawdzie i wzajemnym przebaczeniu win, mimo straszliwych cierpień, jakich Polska doznała od swych sąsiadów.